Imunoglobulinski domen

IImunoglobulinski domen
	Struktura fragmenta koji se vezuje za antigen antitela
Identifikatori
Simbol	ig
Pfam	PF00047
Pfam klan	CL0011
InterPro	IPR013151
PROSITE	PDOC00262
SCOP	8fab
Superfamilija	8fab
Dostupne PDB strukture:
Pfam	structures
PDB	RCSB PDB; PDBe
PDBsum	strukturni pregled

Imunoglobulinski domen je tip proteinskog domena koji se sastoji od dvoslojnog sendviča sa 7 i 9 antiparalelnih β-lanaca koji formiraju β-ravni sa topologijom Grčkog kluča.^[1]^[2]

Aminokiselinski lanac više puta prelazi iz jedne β-ravni u drugu. Tipičan obrazac je (N-terminalna β-ukosnica u ravni 1)-(β-ukosnica u ravni 2)-(β-lanac u ravni 1)-(C-terminalna β-ukosnica u ravni 2). Prelazi između dve ravni formiraju "X", tako da su N- i C-terminalne ukosnica jedna naspram druge.

Članovi imunoglobulinske superfamilije su prisutni u stotinama proteina sa različitim funkcijama. Primeri tih proteina su antitela, gigantska mišićna kinaza titin i receptorske tirozinske kinaze. Imunoglobulinu slični domeni mogu da učestvujuju u protein–protein i protein–ligand interakcijama.^[3]

Primeri

Ljudski geni koji kodiraju proteine sa imunoglobulinskim domenom:

Reference

↑ Bork P, Holm L, Sander C (September 1994). „The immunoglobulin fold. Structural classification, sequence patterns and common core”. J. Mol. Biol. 242 (4): 309–20. DOI:10.1006/jmbi.1994.1582. PMID 7932691.
↑ Brümmendorf T, Rathjen FG (1995). „Cell adhesion molecules 1: immunoglobulin superfamily”. Protein Profile 2 (9): 963–1108. PMID 8574878.
↑ Williams AF, Barclay AN (1988). „The immunoglobulin superfamily—domains for cell surface recognition”. Annu. Rev. Immunol. 6: 381–405. DOI:10.1146/annurev.iy.06.040188.002121. PMID 3289571.

Spoljašnje veze

SCOP listing of immunoglobulin domains of known structure Arhivirano 2010-01-16 na Wayback Machine-u

[pmid7932691-1] Bork P, Holm L, Sander C (September 1994). „The immunoglobulin fold. Structural classification, sequence patterns and common core”. J. Mol. Biol. 242 (4): 309–20. DOI:10.1006/jmbi.1994.1582. PMID 7932691.

[pmid8574878-2] Brümmendorf T, Rathjen FG (1995). „Cell adhesion molecules 1: immunoglobulin superfamily”. Protein Profile 2 (9): 963–1108. PMID 8574878.

[pmid3289571-3] Williams AF, Barclay AN (1988). „The immunoglobulin superfamily—domains for cell surface recognition”. Annu. Rev. Immunol. 6: 381–405. DOI:10.1146/annurev.iy.06.040188.002121. PMID 3289571.

[1]

[2]

[3]

p r u Tercijarna struktura proteina
Generalni	Strukturni domen • Proteinsko sklapanje • Proteinska struktura
Sve-α sklop:	Heliksni svežanj • Globinski sklop • Homeodomenski sklop • Alfa solenoid
Sve-β sklop:	Imunoglobulinski domen • Beta barel • Beta-propeler
α/β sklop:	TIM barel • Leucinom-bogato ponavljanje • Flavodoksinski sklop • Rozmanov sklop • Tioredoksinski sklop • Trolistni čvorni sklop
α+β sklop:	DNK spona • Feredoksinski sklop • Ribonukleaza A • SH2-slični sklop
Neregularni sklopovi:	Konotoksin
←Sekundarna struktura Kvaternarna struktura→

Primeri

Reference

See also

Spoljašnje veze